Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms