Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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