Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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