Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PLXNA4Q9HCM2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PLXNA4Q9HCM2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms