Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLSPNQ9HAW4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms