Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KLHL4Q9C0H6 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL4Q9C0H6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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