Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms