Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAPERQ9BY12 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms