Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BRIP1Q9BX63 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BRIP1Q9BX63 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms