Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PMCHL2Q9BQD1 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms