Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms