Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIT2Q99578 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.3 ms