Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CXorf38-203ENST00000378426 4895 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms