Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC97Q96F63 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms