Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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SPTSSAQ969W0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SPTSSAQ969W0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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