Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF548Q8NEK5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF548Q8NEK5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms