Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms