Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms