Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC01545Q5VT33 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC01545Q5VT33 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC01545Q5VT33 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC01545Q5VT33 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC01545Q5VT33 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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LINC01545Q5VT33 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LINC01545Q5VT33 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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