Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZBED5Q49AG3 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZBED5Q49AG3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms