Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms