Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FHOD3Q2V2M9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms