Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NRF1Q16656 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms