Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FXNQ16595 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FXNQ16595 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FXNQ16595 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FXNQ16595 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FXNQ16595 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FXNQ16595 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FXNQ16595 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FXNQ16595 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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FXNQ16595 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FXNQ16595 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FXNQ16595 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FXNQ16595 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FXNQ16595 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FXNQ16595 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FXNQ16595 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FXNQ16595 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FXNQ16595 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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