Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SGCBQ16585 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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