Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNAPC1Q16533 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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SNAPC1Q16533 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SNAPC1Q16533 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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