Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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NEDD8Q15843 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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NEDD8Q15843 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NEDD8Q15843 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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