Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIP13Q15645 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms