Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
RYR3Q15413 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC007622.1-201ENST00000488371 535 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PUDPP2-202ENST00000628080 737 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.180-201ENST00000612546 322 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AP000346.1-201ENST00000390329 1087 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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RYR3Q15413 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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RYR3Q15413 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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RYR3Q15413 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
RYR3Q15413 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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