Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PCM1Q15154 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms