Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCLAFQ15004 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms