Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms