Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMCO1Q147U7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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