Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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COL4A6Q14031 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
COL4A6Q14031 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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