Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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CNGB1Q14028 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CNGB1Q14028 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CNGB1Q14028 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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