Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CBFBQ13951 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms