Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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DDX39BQ13838 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DDX39BQ13838 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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