Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SPTAN1Q13813 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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