Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1SQ13698 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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