Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TSTA3Q13630 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms