Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
IRF5Q13568 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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