Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
EIF4EBP1Q13541 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms