Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AADACP1-203ENST00000471766 707 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC244131.1-201ENST00000542152 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC079336.6-201ENST00000624836 613 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AP000962.2-201ENST00000624971 1101 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL138729.1-201ENST00000406666 664 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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