Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SRSF5Q13243 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SRSF5Q13243 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SRSF5Q13243 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SRSF5Q13243 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SRSF5Q13243 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SRSF5Q13243 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SRSF5Q13243 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SRSF5Q13243 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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