Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAF1Q13077 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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TRAF1Q13077 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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TRAF1Q13077 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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TRAF1Q13077 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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TRAF1Q13077 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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TRAF1Q13077 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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TRAF1Q13077 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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TRAF1Q13077 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAF1Q13077 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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