Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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