Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RAB40BQ12829 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB40BQ12829 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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