Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TROQ12816 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TROQ12816 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TROQ12816 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TROQ12816 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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