Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA3Q08378 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA3Q08378 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms