Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUCB1Q02818 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUCB1Q02818 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms